מוצאם של רוב הקראים במדינת ישראל הוא בקראי מצרים. מספר הקראים מוערך בישראל בכ־40 אלף נפש ועוד כ־20 אלף בקהילות קראיות הפזורות בארצות־הברית, בקנדה, בטורקיה ועוד. בארץ יש קהילות קראיות בערים רמלה, אשדוד, ירושלים, בת־ים, ראשון לציון, קריית־גת, אופקים ובאר־שבע, וכן במושבים: מצליח, רנן ובית עזרא. לקהילות הקראיות בארץ 14 בתי כנסת ב־12 המרכזים. בית הכנסת הגדול ביותר נמצא באשדוד, כשברמלה נמצא מבנה "מרכז היהדות הקראית העולמית".